在进行研究生论文万方查重时，首先要保证论文的原创性，避免抄袭现象。其次，要注意文献引用格式的规范，避免格式错误导致查重率升高。另外，可以利用万方查重系统提供的修改建议进行论文优化，提高通过率。此外，定期检查论文查重报告，及时调整论文内容，确保通过率。

除了以上提到的方法，还可以尝试通过修改论文结构和语言表达方式来降低相似度，减少重复率。此外，可以使用专业的查重软件进行自查，及时发现问题并进行修改。另外，可以寻求导师或同行的意见和建议，帮助发现论文中存在的问题并进行改进，提高通过率。